我的flashgot版本是0.5.96.060910

关于单窗口打开的问题总算解决了。
在mozillazine里找到了答案http://forums.mozillazine.org/viewtopic.php?t=459600&highlight=single+window
关于browser.link.open_newwindow.restriction
2.0之前是设置成3
2.0后改成设置为0，实现单一窗口打开。